R pour les géographes :

Éléments d'analyse de données géographiques, d'analyse spatiale et de cartographie avec R.

UMR Géographie-cités

Introduction

Le présent document est réalisé par le groupe ElementR, groupe de huit auteur-e-s coordonné par Hadrien Commenges. Il est le fruit de sessions de formation au logiciel R organisées à l'UMR Géographie-cités durant l'année 2012. Le résultat de ce travail collectif est mis à disposition sous licence Creative Commons, dans le respect de l'esprit de partage des connaissances qui est le fondement de R et la raison de son succès.

Ce manuel a pour ambition d'offrir un support technique à des étudiants, enseignants-chercheurs, ingénieurs, etc. qui partagent notre intérêt pour l’utilisation des méthodes d’analyse des données en géographie et souhaiteraient pouvoir développer leurs travaux à l'aide du logiciel libre R. Plus spécifiquement nous proposons dans ce manuel une prise en main dédiée à des personnes s’initiant simultanément au traitement de données géographiques et à l’environnement R. L’éclairage est celui de l’analyse spatiale, à savoir des méthodes mises en œuvre pour l’étude des organisations dans l’espace. Ce manuel est largement inspiré d’autres manuels « R » spécifiques ainsi que de nos différents cours pour les aspects méthodologiques : ils sont signalés dans le manuel pour permettre aux utilisateurs de les approfondir.

Il s’agit d’une première version, où nous avons tenté d’harmoniser les différents chapitres et qu’ils portent tous sur les mêmes jeux de données. Notre objectif était d’en faire un document pédagogique tant sur le point de vue de la méthode que sur les implémentations. Nous avons cependant bien conscience qu’il est perfectible et nous invitons les utilisateurs ce manuel à nous faire part de tout commentaire, critique ou suggestion à l'adresse suivante : elementr [CHEZ] parisgeo.cnrs.fr dans la perspective d’une version améliorée.

Table des matières

    1. R pour ...
    2. Plan et fil pédagogique
    3. Introduction à R
    4. Utilisation de l'aide et des raccourcis
    5. Conventions d'écriture
    6. L'exemple et les données
    1. Description et manipulation des objets proposés par R
    2. Importation et exportation
    3. Manipulation avancée de données
    4. Code
    1. Manipulation des fonctions sous R
    2. La famille des fonctions *apply()
    3. Manipulation avancée de données
    4. Code
    1. Calculs simples et recodages
    2. Résumés statistiques
    3. Représentations graphiques des distributions statistiques
    4. Code
    1. Relation entre deux variables quantitatives
    2. Relation entre une variable quantitative et une variable qualitative
    3. Relation entre deux variables qualitatives
    4. Code
    1. Réaliser une analyse en composantes principales
    2. Réaliser une analyse factorielle des correspondances
    3. Code
    1. Rappels méthodologiques
    2. Classification d'entités décrites par des variables quantitatives hétérogènes
    3. Classification des lignes d'un tableau de contingence
    4. Code
    1. Préparation des données
    2. Description des graphes à l'aide de mesures globales
    3. Description des graphes à l'aide de mesures locales
    4. Cliques et communautés
    5. Visualisations
    6. Code
    7. Pour aller plus loin
    1. Objectifs et prérequis
    2. Prise en main des données spatiales
    3. Cartographie des objets ponctuels : cercles proportionnels
    4. Cartographie des objets zonaux : cartes choroplèthes
    5. Code
    1. Mesurer les espacements d'une distribution ponctuelle
    2. Mesure de l'autocorrélation spatiale et des ressemblances locales
    3. Code

Les auteurs

Laurent BEAUGUITTE Élodie BUARD Hadrien COMMENGES Robin CURA
Laurent BEAUGUITTE,
IDEES
Élodie BUARD,
COGIT, Géographie-cités
Hadrien COMMENGES,
Géographie-cités
Robin CURA,
Géographie-cités
Florent LE NÉCHET Marion LE TEXIER Hélène MATHIAN Sébastien REY
Florent LE NÉCHET,
LVMT
Marion LE TEXIER,
Géographie-cités,
Université du Luxembourg
Hélène MATHIAN,
Géographie-cités
Sébastien REY,
Géographie-cités

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